免费论文摘要：H5N1流行性感冒宏病毒内切酶催化水解RNA反馈机理的表面接洽

?H5N1宏病毒是一种高致病性禽流行性感冒宏病毒，传递性强、人熏染后牺牲率高。其会合酶对宏病毒的繁衍中起到了要害效率。接洽流行性感冒宏病毒会合酶的内切酶切割RNA的催化反馈机理，不妨从微观观点引导关系药物的研制。本论文华用密度泛函本领和Hartree-Fock本领对H5N1宏病毒会合酶的PAN亚基中的内切酶催化水解RNA链反馈机理举行了接洽。以X-射线晶体构造为普通，镁离子为重心，采用活性重心84个亚原子动作模子。沿用各别的计划本领对此模子举行优化，优化后的模子与晶体数据比拟挑选出精度最高精确度最好的最好优化计划本领——H-F法。又安排了含有单非金属离子的模子。鉴于这两个模子探究了3个大概的反馈道路。每个反馈道路均包括了三个要害办法。探求各个反馈物、中央体、过度态和产品，用HF/6-31G(d,p)本领举行优化和计划频次。沿用B3LYP/6-31G(d,p)本领计划单点能，经过领会位能面，对能量举行比拟，以决定最好反馈路途。截止表白与镁配位的潮气子做为亲核试药的根源其反馈能垒最低，证明二价的镁离子在潮气子的质子变化的进程中起到了要害的催化效率。沿用QM/MM本领在ONIOM(HF:UFF)程度上优化了H5N1宏病毒内切酶在举行催化水解RNA链前和中断时的两种构型，并计划其振荡频次，获得IR光谱。

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