免费论文：面向大范围底栖生物医药运用的并行计划框架接洽与实行

连年来，受生去世学，数字风洞，高能物理，资料科学等各上面大范围计划运用的启动，超等计划机的兴盛特殊赶快，短短几年功夫，TOP 500 榜单的计划本能就有了两个数目级地提高。在超等计划范围上，异构并行计划无疑是最超过新本领，更加是对准于大范围并行计划本领。异构并行计划情况因为其高本能，拙劣耗等个性，在超等计划机中的比例越来越大，已被普遍运用于计划聚集型和数据聚集型的运用。面临越来越搀杂的大范围异构计划情况，动静的工作安排变成了普及体例本能的一个要害性的成分，对于异构的大范围并行体例的工作安排的目的主假如按照处置机的各别计划本领，搜集带宽等本能参数来实行计划工作到计划体例的映照，进而尽大概满意用户对计划功效的诉求，囊括最小计划功夫，最小计划功耗，最大计划功效等目的。对于大范围和超大范围计划而言，这个映照利害常艰巨的，须要商量搀杂的负载平衡，计划真实性，搜集延时等题目，正如并行计划不是大略的串行并行化，大范围计划中范围搀杂度远远胜过了预期。鉴于上述思维，对准新药研制和卵白质折叠数值模仿计划上面总体计划量大、计划工作不准则、搜集本能诉求高档多上面的题目，正文安排并实行了一个轻量级的并行计划框架计划，并实行了一个发端的原形体例，不妨实行大范围底栖生物医药异构计划体例的映照题目，并不妨精巧监察和控制处置计划的运奇迹态，保护计划的成功运转。在框架构造中，正文重要提出了分群分批，资源优化配合等战略来缓和大范围下主节点的通讯和计划瓶颈。正文重要对原形框架的体例框架结构做了比拟深刻的引见领会，囊括分群分批，资源优化配合体制，主从监察和控制等几个上面举行了计划，并在对上述体制的原形体例给予实行的。同声，正文对原形体例举行了功效性考证，试验截止表明在大范围的情况下，该体例框架不妨灵验映照计划工作，主节点CPU 负载，搜集负载，IO负载一直维持在较低程度，在计划体例大范围扩充的普通上，不妨连接扩充，灵验监察和控制。

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