免费论文摘要：黑尾地鸦和银脸长尾山雀线粒体基因组序列测定与体例发育领会

众生线粒体基因组具备容易获得、长度及基因构成对立宁静、进化速度快、母系遗传等特性，已被普遍用来谱系地舆、百般分门别类阶元间体例发育联系和集体遗传学等范围的接洽。截止2010年2月，NCBI中已收录的鸟类全线粒体基因组序列共110条。雀形目动作鸟纲中最大的目，暂时惟有11种鸟类的全线粒体基因组序列被测定。雀形目品种多、数目大、样式百般、动作搀杂，相关该类群的发源及各科衍化联系生存着不少争议，从来是鸟类体例学接洽热门。线粒体基因组中的基因，已越来越多被运用于商量雀形手段体例发育联系，但基因比较接洽的证明表白，运用各别的基因，体例爆发联系的截止不普遍。简单基因的领会大概对如实的物种进化联系作堕落误的推广。为了进一步接洽雀形目鸟类线粒体基因组的构造构造及序列特性，为雀形目鸟类进化接洽供给新的基因组学消息，本接洽沿用长PCR扩大与增加的线粒体DNA和引物步移法，测定了黑尾地鸦和银脸长尾山雀的线粒体基因组。并参照红原鸡、秃鼻乌鸦和黑顶林莺等线粒体基因组解释消息，对拼接之后的2条线粒体基因组全序列举行了解释和构造领会。同声，本接洽共同GenBank已公然的数据和本试验室测定的其它物种的线粒体基因组数据，对雀形目体例发育联系举行了重修。赢得的重要截止如次：1.?????? 黑尾地鸦和银脸长尾山雀的线粒体基因组全长辨别为16, 867 bp和17, 953 bp，源代码13个卵白质源代码基因，22个tRNA基因，2个rRNA基因和1个遏制区(D-Loop区)。这两种鸟类线粒体基因组在构造上的重要辨别有2点：银脸长尾山雀多了一个假遏制区；黑尾地鸦线粒体基因组十足37个源代码基因的对立场所及转录目标均与典范的鸟类线粒体基因组普遍，而银脸长尾山雀线粒体基因组十足37个源代码基因的对立场所及转录目标均与黑顶林莺线粒体基因组普遍，在ND5至12S rRNA之间的基因陈设程序为Cyt b/tRNAThr/CR/tRNAPro/ND6/tRNAGlu/ΨCR。2.?????? COI基因在黑尾地鸦和银脸长尾山雀中辨别以GTG和ATG动作开始暗号子。其它12个卵白源代码基因均以ATG动作开始暗号子。大局部卵白源代码基因以TAA、AGG或AGA动作中断暗号子，惟有COⅢ，ND4基因均以T动作中断暗号子。3.?????? 黑尾地鸦除tRNASer(AGY)的DHU臂缺点和失误，tRNALeu(CUN)的反暗号子环由9个碱基形成，而不是规范的7个碱基外，其他20个tRNA基因都具备规范的三叶草构造。银脸长尾山雀除tRNASer(AGY)的DHU臂缺点和失误，其他21个tRNA基因都具备规范的三叶草构造。黑尾地鸦和银脸长尾山雀的tRNA二级构造中，均生存碱基错配局面，个中绝大局部错配为G-U错配。4.?????? 黑尾地鸦和银脸长尾山雀线粒体基因组12S rRNA和16S rRNA二级构造举行了猜测。两个物种的12S rRNA二级构造均包括4个构造域，43个茎环构造。16S rRNA二级构造均包括6个构造域，55个茎环构造。5.?????? 黑尾地鸦和银脸长尾山雀同其它鸟类一律，遏制区中生存F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box和CSB1-box。遏制区未创造H链复制开始序列(OH)和双向复制开始(LSP/HSP)，估计其大概经过产生与其它物种一致的空间构造来运用同样的功效。6.?????? 运用线粒体基因组的3个卵白源代码基因(ND2，ND4，ND5)、rRNA基因(12S rRNA和16S rRNA)和21个tRNA基因(除tRNASer(AGY))对16种雀形目鸟类沿用加权或等权的MP法、ML法和贝叶斯法建立体例发育树。3种本领均很好的扶助保守样式分门别类和分子分门别类体例将雀形目分别为鸣禽和亚鸣禽两个大类群的截止。但3种本领体例发育领会的截止表白，琴鸟属于鸣禽，而不是保守分门别类的亚鸣禽。不扶助鸦小手段单系性，扶助将地山雀归属山雀科下，银脸长尾山雀单列成科。

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