免费论文摘要：三种雀形目鸟类线粒体基因组测定及雀形目鸟类体例爆发接洽

雀形目鸟类品种多，数目大，散布普遍，样式百般，动作搀杂，从来是鸟类体例学接洽的热门，相关该类群的体例爆发联系仍生存很多有争媾和未处置的题目。众生线粒体基因组具备分子构造大略、进化速率快、母系遗传、容易获得等特性，已变成接洽鸟类发源、进化及体例爆发联系等的理念资料。以单个基因或几个基因的大略共同对雀形目体例爆发联系的接洽常常会展示各别以至彼此冲突的截止。所以，越来越多的鸿儒采用运用线粒体基因组全序列来建立雀形目鸟类的体例爆发联系。本接洽鉴于L-PCR和Sub-PCR扩大与增加及引物步移法测定了中华攀雀（Remiz consobrinus）、银喉长尾山雀长江亚种（Aegithalos caudatus glaucogularis）和银喉长尾山雀点名亚种（Aegithalos caudatus caudatus）的全线粒体基因组序列，并对拼接好的序列举行解释和领会。共同GenBank数据库及本试验室测定的共46条雀形目鸟类全线粒体基因组序列，以雁形目两个物种为外群，重修了雀形目鸟类的体例爆发联系。重要截止如次：1. 中华攀雀、银喉长尾山雀长江亚种和点名亚种的全线粒体基因组长度辨别为16737 bp、17937 bp和17935 bp，均源代码囊括13个卵白源代码基因、2个rRNA基因和22个tRNA基因在前的37个基因。序列均不生存鲜明的碱基偏差性。中华攀雀线粒体基因排序与绝大普遍鸟类一律，具备一个坐落tRNAGlu和tRNAPhe间的遏制区。银喉长尾山雀长江亚种和点名亚种线粒体基因组具备两个遏制区，辨别坐落 tRNAThr 和 tRNAPro 及 tRNAGlu 和 tRNAPhe 间，两个遏制区的序列基础普遍。2. 鸟类线粒体基因组各别地区的进化速度各别，遏制区的进化速度最快，其次是卵白源代码基因，tRNA和rRNA基因的进化速度对立较慢。3. 3个物种13个卵白源代码基因中，运用度数最多的暗号子为CTA、ATC、CTC、TTC和GCC，运用最一再的氨基酸酸为Leu、Thr、Ala、Ile 和 Ser。开始暗号子运用上面，除中华攀雀ND3基由于ATT，银喉长尾山雀长江亚种和点名亚种为ATA外，其他基因均为典范的ATG。 局部雀形目鸟类 COI 基因的开始暗号子为GTG。中断暗号子运用上面，3个物种除 COIII 和 ND4 基由于不实足中断暗号子T外，其他基因均为典范的实足中断暗号子（TAA、TAG、AGA 和 AGG）。局部雀形目鸟类中创造了不实足中断暗号子TA。银喉长尾山雀长江亚种和点名亚种一切基因的开始和中断暗号子实足沟通。 4. 3个物种 tRNA 二级构造中，tRNASer-AGN 均缺点和失误了二氢尿嘧啶（DHU）臂，其他均产生了典范三叶草构造。3个物种均生存碱基错配局面，大局部为罕见的G-U 错配。5. 3个物种 rRNA 二级构造完全上很一致，SrRNA 二级构造包括 3 个构造域，47 个茎环构造；LrRNA 二级构造包括 6 个构造域，60 个茎环构造。6. 3个物种遏制区中均生存 F-box、D-box、C-box、B-box、Bird similarity-box 和 CSB-1 构造。与红原鸡比拟，46 种雀形目鸟类的 CSB-1 构造中均生存  18~21 bp 不等的核苷酸插入局面。个中，中华攀雀生存 20 bp 的核苷酸插入，银喉长尾山雀长江亚种和点名亚种均生存 19 bp 的核苷酸插入。7. 将线粒基因组全序列和卵白源代码基因辨别构成ALL和PCG两个数据集，辨别用最大似然法、最大简单法和贝叶斯法重修体例爆发树商量雀形目鸟类的体例爆发联系。截止表白：琴鸟科和吸蜜鸟科为鸣禽亚手段姊妹群，且吸蜜鸟科有比琴鸟科与鸣禽亚目更近的亲缘联系；燕雀类和鹀类应提高为科级程度，鹟类和鸫类为亚科级程度，一齐归属鹟科下；长尾山雀类、山雀类和攀雀类均应独力成科，归属莺总科下；鹟科与莺类的亲缘联系较远，攀雀科与山雀科亲缘联系较近；黑眉长尾山雀与银脸长尾山雀，池沼山雀与褐头山雀，绿背山雀与大山雀亲缘联系较近；扶助鸦小目、雀小目及雀小目中鹟总科、雀总科和莺总科的单系性，同声，鹟总科中的鹟亚科、鸫亚科，雀总科中的燕雀科和鹀科，莺总科中的长尾山雀科、攀雀科和山雀科的单系性均获得了扶助。8. 对两个数据集比拟创造，ALL 数据集比 PCG 数据集在处置雀形目鸟类的体例爆发联系上有更好的领会力。

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