免费论文摘要：两种蜻蜓全线粒体基因组的高通量测序及蜻蜓目体例发育领会

众生线粒体DNA（Mitochondrial DNA）的序列和构造是暂时众生基因组接洽的热门。接洽实质囊括：DNA序列测定、碱基构成领会、暗号子构造、RNA二级构造、基因陈设程序等。那些消息可用来众生体例发育和进化接洽。固然有洪量虫豸的线粒体DNA全序列已获得接洽，但蜻蜓目仅通讯了11种蜻蜓的线粒体DNA全序列，扇蟌科没有物种举行过全线粒体基因组测序，色蟌科仅有一个物种做过全线粒体基因组测序，接洽对立较少。本接洽沿用高通量测序的本领对扇蟌科的白扇蟌（Platycnemis foliacea）和色蟌科的玄色蟌（Agrion atratum）线粒体基因组全序列举行测定，并举行线粒体全基因组的拼接、解释和领会。从而贯串NCBI数据库已收录的11种蜻蜓目线粒体基因组的PCGs、rRNAs和rRNAs & PCGs三个数据集，以蜉蝣手段东方蜉蝣（Ephemera orientalis ）为外群，沿用最大简单法（Maximum Parsimony, MP）、最大似然法（Maximum Likehood, ML）和贝叶斯推广法（Bayesian inference, BI）建立体例发育树，对蜻蜓目物种的体例爆发联系举行领会。重要论断如次：1. 白扇蟌和玄色蟌mtDNA全序列长度辨别为15418 bp 和15506 bp，其线粒体基因组均囊括：13个卵白基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因以及一个A+T充分区。个中4个卵白基因、8个tRNA和2个rRNA基来由L链源代码，结余的其余基因则由H链源代码。白扇蟌mtDNA基因臃肿区14处44 bp，基因间隙区8处72 bp；玄色蟌mtDNA基因臃肿共12处40 bp，基因间隙共10处77 bp。白扇蟌和玄色蟌mtDNA全序列及其各局部的碱基构成均具备AT偏差性，A+T的含量大于G+C的含量。其AT偏私值和GC偏私值为恰巧时，表白碱基A的含量大于T的含量，G的含量大于C的含量，反之表白碱基A的含量小于T的含量，G的含量小于C的含量。2. 白扇蟌和玄色蟌线粒体基因组13个卵白质源代码基因中，个中以ATN开始暗号子的卵白基因辨别为6个（ND2、COⅡ、ATP8、COⅢ、ND6和Cytb）和8个（ND2、COⅡ、ATP8、COⅢ、ND6、ND3、Cytb和ND1），以AAT开始的卵白基因辨别为3个（ND5、ND4和ND4L）和4个（COⅠ、ND5、ND4和ND4L），其结余的辨别以TTN和TTG开始。两种蟌的线粒体基因组13个卵白源代码基因中均囊括两种中断暗号子：实足中断暗号子和不实足中断暗号子。白扇蟌和玄色蟌mtDNA均源代码22个tRNAs基因，散布于rRNAs基因和PCGs之间。其tRNAs基因二级构造中，碱基错配辨别为37处和32处，均以G-U错配为主。白扇蟌和玄色蟌的rRNAs基因（s-rRNA和l-rRNA）均坐落tRNALeu(L2)基因与A+T rich region之间。两种蟌的遏制区均坐落s-rRNA与tRNAIle之间，A+T%含量辨别为81.3%和87.1%，均生存A+T的偏差性。3. 13种蜻蜓目虫豸线粒体全序列核苷酸A、T 、G、C的运用情景中，碱基A的含量均为最高，碱基G的含量均为最低。其线粒体PCGs，卵白质源代码基因H链和L链的碱基运用情景中，含量最高的均为碱基T，含量最低的是碱基C和G。13种蜻蜓目虫豸mtDNA全序列及各局部的碱基构成均具备AT偏差性，A+T的含量大于G+C的含量。在暗号子运用上，13种蜻蜓目虫豸线粒体基因组卵白质源代码基因的H链，L链及PCGs均具备偏好性。RSCU领会表露，以碱基A或碱基T结果的那些同义暗号子的展示度数远高于其他同义暗号子的展示度数。4. 以13种蜻蜓目虫豸线粒体基因组PCGs和rRNAs & PCGs数据集辨别建立体例发育树，运用MP、ML和BI法。在这三种本领建立的体例发育树中均是将蜻蜓目聚为了两个分支，各分支的拓扑构造基础沟通。个中第一次主要分支中扇蟌科的白扇蟌与蟌科的波瘦蟌聚在一道产生姊妹群，溪蟌科与色蟌科和拟丝蟌科聚在一道。另一分支中蜻科与伪蜻科聚在一道。而在rRNAs数据会合，运用三种本领建立的体例发育树与PCGs和rRNAs & PCGs数据集有些分别。体例发育领会的截止表白蟌蜓科的体例发育位置还不许决定。其余拟丝蟌科的丽拟丝蟌与溪蟌科的短腹幽蟌的亲缘联系，及同一蜻科中各别属的3个种之间的亲缘联系也须要进一步的接洽。 

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